Pese a este descalabro, los universitarios llegaron nuevamente a la semifinal en el Torneo de Apertura 2002. Su rival en turno, los Monarcas de Morelia, le asestaron una goleada de 4-0 en el partido de ida. Allí obtuvo una victoria por 2-0, con goles de Funes Mori (a los 44 minutos) e Isaác Brizuela (a los 83′, en contra). Pero en semifinal, perdieron el duelo al caer ante quien sería el subcampeón del mismo torneo, el Guadalajara.
